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高通量测序技术用于微生物多样性分析,测序量可达到普通测序的几百倍,而测序费远低于普通测序。可对环境微生物的DNA直接进行深度测序,进而分析环境微生物的群落结构、系统进化、基因功能差异及代谢网络等,这使得微生物菌群检测日益成为新的研究热点,极大的促进了对环境中不可培养微生物以及痕量菌的研究,为环境微生物多样性的研究开启了新的研究热潮。应用主要有两方面:一是对所有微生物DNA进行宏基因组测序,关注样品中菌群组成、系统进化和功能基因的研究和发掘;二是基于16SrDNA, 18srDNA, ITS区域进行扩增测序,分析微生物的群体构成和多样性,探求微生物与环境,微生物与宿主之间的关系等;后者针对特异区域进行PCR扩增并测序,由于操作简便,仅需很少的数据量即可提供环境样本物种分类,物种丰度,种群结构,系统进化,群落比较等诸多信息,在微生物分类鉴定,微生态研究方等方面起到重要作用。
1.送检的菌种样品必须确保无致病性,并在无致病性栏中填写无;有致病性的样品只接受基因组DNA,样品有致病性,导致污染和扩散,由提供方承担相应后果;
2.若样品为基因组DNA,DNA浓度>20ng/ul,体积大于20ul;如果是菌种,请送培养好的菌;
3.菌种不纯会导致测序出现套峰,因此得不到鉴定结果,如遇这种情况,正常收费;
4.对于鉴定的菌株,不做备份及保留,请送检之前做好保种工作,如有疑问请在收到结果7个工作日内联系我们,过期我们会销毁样品,不予处理;
5.如样品原因扩增不成功导致鉴定失败,会取消该样品的项目服务;若因用户提供的样品与需要鉴定的类型不符,导致实验失败,委托人需支付全部项目费用;
6.样本取样后需保存在-80℃,寄送条件为干冰寄送,请提前自行准备足量干冰。液体样品提供5-10ml,固态样品提供5-10g具体情况具体分析。
1.可以接受哪些样本?
样品可以为水样、土壤、肠道内容物、固废等。
2.污水样品想测微生物组成,是不是细菌和真菌都需要做呢?
看实验目的,是想分析哪方面的菌落组成,细菌和真菌都是可以做的。