蛋白质质谱鉴定：段离子分离开来，经过检测器收集分离的离子，确定每个离子的M/Z值。经过质量分析器可分析出每个肽段的M/Z，得到蛋白质所有肽段的M/Z图谱，即蛋白质的一级质谱峰图。离子选择装置自动选取强度较大肽段离子进行二级质谱分析，输出选取肽段的二级质谱峰图，通过和理论上蛋白质经过胰蛋白酶消化后产生的一级质谱峰图和二级质谱峰图进行比对而鉴定蛋白质。常用的方法是利用蛋白酶（包括胰蛋白酶、胃蛋白酶等，可指定）将大分子的蛋白质酶解成小分子的肽段，再过滤膜(3KD)后进入LCMSMS进行分析，样品被离子化后进入质谱仪，得到一级质谱图后，筛选母离子进行二级质谱图解析肽段序列。最后综合分析比对得出蛋白质的一级氨基酸序列。

1.常见样本：常规动物组织（心、肝、脾、肺、肾、肠、脑、肌肉等）、叶、花、果实、种子，组织推荐送样量：≥ 200mg；

2.胶点肉眼可见，要求条带清晰，无降解；胶条推荐送样2管；

3. 蛋白溶液 500ul,蛋白粉末1mg

4.寄送方式：组织或蛋白液干冰寄送；胶条或胶点常温或冰袋寄送

5.前处理方法：常规动物组织建议方法：PBS洗涤去除残留血液和污染物，并迅速剔除组织表面的筋皮及脂肪等结缔组织，用手术剪将组织剪成1cm3 左右的小块（约花生米般大小），将组织块装入冻存管中，旋紧盖子。迅速置于液氮冷冻5min，之后转移至-80℃ 保存，干冰运输；

植物组织建议方法：在与研究目的不冲突的前提下，尽量选取新鲜、幼嫩、生长状态良好的组织部位。如样品表面污渍较多，在采集之前用无菌水擦拭或冲洗干净，再用吸水纸吸干样品表面残留液体。取样后马上放入冻存管或者干净的锡箔纸内，液氮速冻，-80℃保存，干冰运输；

胶点建议方法：用移液枪头将2D点挖下来，加入已装有超纯水的离心管中；胶条建议方法：电泳完后用R250染色。请不要使用G250染色，因为后期脱色不干净，易产生污染。将需要鉴定的SDS-PAGE条带切下，装进1.5mL离心管中，每切一个条带，清洗刀片，避免小碎胶的污染。常温或冰袋寄送，颜色非常浅的条带可取多个重复样品放一起。

1.用的什么蛋白酶酶切呢？

一般用的是胰蛋白酶或者胃蛋白酶，如果您这边指定也是可以的，自行提供也可以。

2.比对UniProt数据库可以吗？

比对的就是UniProt数据库。

3.为什么需要物种信息呢？

因为在比对数据库的时候选择对应的物种，这样比对的结果更准确。

4.蛋白是在A物种上培养的B物种，可以两个物种都选择吗？

可以的。